El centro médico del Danok Bat se encuentra en la Calle Zumarraga número 14 del barrio de Santutxu en Bilbao. Está a un minuto de la instalación de Ángeles Custodios y a 10 minutos a pie de los campos de fútbol de Maiona y de la sede del Club.
Cuenta con 2 secciones diferenciadas:
- Área de fisioterapia: es dónde ejercen su labor los fisioterapeutas del club. Consta de 2 camillas y el equipo necesario para tratar a los jugadores
- Gimnasio de prevención y recuperación: es uno de los espacios donde el equipo de preparadores físicos y el readaptador realizan su labor. Cuentan con el equipo y el material adecuado para realizar un trabajo de prevención y un trabajo de readaptación eficaz.